PLANT GENOMICS
Lotus T2T 基因组
围绕百脉根 Gifu 与 MG20,连接端粒到端粒组装、基因注释、基因组结构比较与表达分析。
RESEARCH & EXPLORATION
BIOINFORMATICS · START HERE
生物信息学基础教程:读懂参考基因组与 Linux 命令,用 Python 和 R 画出统计图,再动手把 RNA-seq 读长比对回基因组,一路做到表达量。
PLANT GENOMICS
围绕百脉根 Gifu 与 MG20,连接端粒到端粒组装、基因注释、基因组结构比较与表达分析。
围绕 Nature Plants 论文,梳理根瘤细胞图谱,并实践表达矩阵处理、数据整合与细胞注释。
转录组RNA-seq 数据处理与差异表达分析,把关键步骤和可视化放在同一条分析路径中。
表观组从亚硫酸氢盐测序比对,到甲基化水平计算与差异甲基化区域识别。
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在具体的问题里积累方法,在分享与交流中继续探索。