笔记与复现
读过的方法，做过的分析，以及让下一次实践更顺畅的细节。
论文复现
大豆根瘤的单细胞与空间转录组
围绕 Nature Plants 论文，梳理根瘤细胞图谱，并实践表达矩阵处理、数据整合与细胞注释。
表观组用 BS-seq 探索 DNA 甲基化
从亚硫酸氢盐测序比对，到甲基化水平计算与差异甲基化区域识别。
转录组从测序数据到差异表达
RNA-seq 数据处理与差异表达分析，把关键步骤和可视化放在同一条分析路径中。
基因组工具RepeatMasker 的安装与使用
准备重复序列分析环境，使用 RepeatMasker 完成基因组重复序列屏蔽。
小 RNA小 RNA 数据分析与 siRNA 筛选
质量控制、序列简并、参考库比对，以及 24 nt siRNA 的筛选步骤。
数据准备获取公共测序数据
从 SRA、ENA 查找测序项目，定位并下载后续分析需要的原始数据。
数据准备查找与获取参考基因组
选择需要的参考基因组与注释文件，为序列分析准备基础数据。
沿着问题，继续往下读
项目中还收录了基因组组装、注释与多组学分析的详细步骤。